Genómica funcional y bioinformática integrativa para identificar genes clave en la interacción entre plantas y hongos patógenos
Los hongos fitopatógenos constituyen una importante amenaza para la producción agrícola. Nuestro grupo estudia los mecanismos moleculares que intervienen en la interacción entre las plantas y estos patógenos, con especial interés en comprender tanto las respuestas de defensa del hospedador como las estrategias utilizadas por los hongos durante la infección. Nuestro principal sistema de estudio es la interacción entre el cultivo de maní y distintos hongos capaces de infectarlo.
A partir de datos de secuenciación de ARN (RNA-seq), analizamos los cambios en la expresión génica que ocurren durante la infección, tanto en la planta como en el hongo. Asimismo, reconstruimos y caracterizamos transcriptomas y realizamos análisis funcionales de los genes y proteínas identificados. Estos estudios se complementan con el análisis de redes de coexpresión génica, que permiten identificar grupos de genes que presentan patrones coordinados de expresión durante distintas etapas de la interacción.
Integramos esta información con la caracterización de proteínas secretadas, efectores, enzimas asociadas con la degradación de la pared celular vegetal, factores de transcripción y otras proteínas vinculadas con la patogenicidad. La integración de evidencia transcriptómica, funcional y de redes permite priorizar genes asociados con la supervivencia, el desarrollo y la capacidad infectiva de los hongos, así como genes involucrados en las respuestas de defensa de las plantas. Este conocimiento puede contribuir a identificar nuevos blancos moleculares y sentar las bases para el desarrollo de estrategias de control más específicas y sustentables.
FONDOS CONCURSABLES DE INVESTIGACIÓN
En curso como directora:
- 2020-2026. Convenio I+D. Fundación Maní Argentino. “Evaluar posibles genes blancos de silenciamiento por RNAi, y conocer el efecto de este mecanismo como posible estrategia de inhibición del crecimiento de hongos fitopatógenos que afectan a Maní. Identificar genes y/o vías metabólicas involucradas en la tolerancia/resistencia frente a Thecaphora frezii”. Directora
- 2018-2024. PICT, categoría temas abiertos, tipo A. Agencia I+D+i. “Expresión diferencial de genes en la interacción Arachis hypogaea – Thecaphora frezii”. Directora.
Finalizados como Directora:
- 2018-2019. PIODO. Ministerio de Ciencia y Tecnología de Córdoba. “Evaluación in vitro del efecto de dos biomoléculas sobre el crecimiento de hongos que afectan al cultivo de maní”. Directora.
PUBLICACIONES (ÚLTIMOS CINCO AÑOS)
- Merino MC, Guidarelli M, Negrini F, De Biase D, Pession A, Baraldi E. Induced expression of the Fragaria × ananassa Rapid alkalinization factor-33-like gene decreases anthracnose ontogenic resistance of unripe strawberry fruit stages. . Mol Plant Pathol. 2019. 20(9):1252-1263. http://dx.doi.org/10.1111/mpp.12837
- Lista completa y actualizada disponible aquí
EQUIPO DE TRABAJO DE LA DRA. MERINO
